Zur Verwaltung großer Literaturbestände bietet intranda Dr. eine Projektverwaltung. Literatur, Stichwörter und Themen können somit z.B. für einzelne Arbeitsbereiche voneinander getrennt werden. Dabei kann derselbe Literatureintrag, dasselbe Stichwort oder dasselbe Thema zugleich innerhalb mehrerer Projekte vertreten sein, so dass sich Änderungen an einem solchen Datensatz auf alle beteiligten Projekte auswirken, ohne dass mehrere Duplikate von Datensätzen gleichzeitig gepflegt werden müssen.